根据最新的数据，重庆药学研究生专业的排名如下：

重庆大学

重庆第二师范学院

重庆文理学院

西南大学

中国人民解放军陆军军医大学

重庆医科大学（临床药学 B+）

重庆理工大学

建议您根据自己的兴趣、学术目标和地理位置等因素，综合考虑这些学校的排名和特色，选择最适合自己的考研院校。