选择两所科研院校的专业时，可以从以下几个方面进行综合考虑：

学校背景及学科排名

985/211/双一流：优先考虑这些学校，因为它们通常拥有更好的科研资源和师资力量。

学科评估评级：查看该专业在第四轮学科评估中的评级，了解该学科在学校中的发展情况和资源聚集情况。

科研兴趣与职业规划

科研兴趣：如果打算继续深造，未来希望进入高校或科研院所，应以专业为导向，科研兴趣应放在第一。

职业规划：考虑未来希望从事的职业方向，选择与之匹配的专业和研究方向。

专业实力与导师

专业实力：比较目标院校的专业实力，优先考虑实力强劲的专业。

导师和课题组：了解各导师和课题组的研究方向和成果，选择与自己兴趣和职业规划相匹配的导师。

地理位置与发展机会

城市发展机会：考虑学校所处的地理位置，尽量选择未来目标就业地区的高校，以便于实习和工作。

学校综合实力与文化

综合实力：除了专业本身，还要考虑学校的综合实力，包括科研经费、师资力量等。

校园文化：了解学校的校园文化，选择与自己价值观相匹配的学校。

专业属性

文理区别：分清专业本身属文属理，选择与自己兴趣和能力相匹配的专业。

难易程度

报考难度：评估本专业在本校的报考难度，选择成功概率较高的报考策略。

热门与冷门专业

热门专业：如计算机科学与技术、电子科学与技术、生物学等，这些专业通常有较高的就业前景和研究热度。

冷门专业：如古生物学，虽然冷门，但因其对生命起源和演化的探索而逐渐走进大众视野，也有其独特的价值。

综合以上因素，可以选择两所科研院校中符合自己兴趣、职业规划和发展需求的专业。建议先确定自己的兴趣和职业目标，然后根据这些因素进行详细的比较和选择。