监理工程师各专业证书的含金量排名如下：

土木建筑工程：

土木建筑工程专业的监理工程师证书需求量最大，市场认可度最高，因此其证书含金量也最高。

交通运输工程：

交通运输工程专业的监理工程师证书需求量次之，随着国家对交通运输事业的持续发展，其证书含金量也在逐年提升。

水利工程：

水利工程专业的监理工程师证书需求量相对较少，但其市场价值也在逐步提升，未来有望继续增长。

综上所述，目前土木建筑工程专业的监理工程师证书含金量最高，交通运输工程次之，水利工程相对较低，但未来都有提升的趋势。建议考生根据自身实际情况和职业规划选择合适的专业进行报考。