高考允许学生选择科目的原因主要有以下几点：

体现高校人才培养需要

高校普遍认为，历史是人文社会科学类专业的基础性学科，物理是自然科学类专业的基础性学科。高中阶段学习历史或物理科目有利于学生为进入大学开展专业学习奠定扎实基础，有利于高校相关专业对学生的培养。

符合教育教学实际

各地普通高中办学条件存在差异，将历史和物理作为考生首选科目之一，可以与现有师资、教室等条件有效衔接，引导不同地区、中学的学生合理选择学习科目，科学规划学业生涯，为进入大学继续深造奠定坚实的专业基础。

有利于学生多样化成长发展

学生可从其余4门科目中任意选考2门，理论上有12种组合。这种设置不仅增加了学生的选择权，而且促进了文理交融，充分体现了以生为本、学其所好、考其所长的原则，更加符合教育发展规律和人才成长规律，为学生成长成才提供更多机会。

培养兴趣和特长

自选科目使学生可以根据自己的兴趣和能力选择课程，有助于发展个人素质和职业能力。

减轻学习负担

通过减少必修科目的数量，学生可以更专注于自己感兴趣和擅长的领域，从而减轻学习压力。

适应高校选拔

高校在招生时往往对文理科有不同的要求，自选科目有助于学生根据目标高校的专业要求做出选择。

促进学生全面发展

自选科目制度鼓励文理交融，有助于学生多样化成长，培养多元智能。

增加选择权

新高考制度下的“3+3”模式允许学生从学业水平考试科目中自主选择3科纳入高考成绩，增加了学生的选择权。

综上所述，高考允许学生选择科目是为了更好地适应高校的人才培养需求，符合教育教学的实际情况，促进学生的多样化成长和发展，同时增加学生的选择权，减轻学习负担，并适应高校选拔人才的需求。