根据搜索结果，福建省内参与闽台合作的高校主要包括以下几类，涵盖本科、专科及高职教育领域：

一、本科层次合作院校

综合类高校

福州大学：与台湾高校合作开展物流管理、电子信息工程等4+0联合培养项目，覆盖人文、社科、理工等领域。

福建师范大学：与台湾40多所高校建立深度合作，涉及人才培养、学科建设等方面。

理工类院校

福建工程学院：与台湾高校实施"分段对接"模式，联合培养应用技术型人才。

厦门理工学院：参与多所台湾高校的联合培养项目。

师范类院校

福建师范大学传播学院：与台湾高校合作开展教师交流与人才培养。

二、专科层次合作院校

高职院校

闽江学院：与台湾中国文化大学、实践大学等合作，每年选派500余名学生赴台学习。

福建信息职业技术学院：与台湾高校开展"校校企"联合培养项目。

泉州师范学院化工与材料学院：与台湾元智大学合作，开展专科层次人才培养。

其他专科院校

三明学院、福建警察学院（闽台合作办学）。

三、合作模式与专业领域

联合培养模式 ：包括"3+1"（本科）、"2+1"（专科）等模式，部分项目由台湾高校直接授课。

合作领域 ：覆盖人文、社会科学、理工、医学、艺术、管理等多个学科领域。

四、注意事项

以上信息综合自鲁芽网等平台，部分项目需关注高校官网或教育部门最新公告。

不同合作院校的项目具体内容、招生专业及学费可能有所差异，建议直接咨询相关高校。

如需进一步了解具体院校或项目，可访问福建省教育厅官网或合作高校招生网站查询。