监理工程师三科难度排名如下：

《建设工程监理案例分析》

被普遍认为是监理工程师考试中最难的科目。案例分析需要考生将其他科目的知识进行融会贯通，并且能够灵活运用到具体的案例中。由于其综合性和主观题的特点，该科目难度较大，要求考生具备较高的综合能力与实操经验。

《建设工程目标控制》

难度仅次于案例分析。该科目主要考察考生对于建设工程目标的控制和管理能力，包括项目进度、质量、安全等方面的控制。考生需要掌握相关的理论知识和实践经验，内容多且题量大，包括大量的计算和图表分析。

《建设工程基本理论与相关法规》

相对于前两门科目，这门科目难度适中。它主要考察考生对于建设工程的基本理论知识以及相关法规的了解程度。虽然涉及的知识点繁杂，但考生通过系统学习和复习，掌握起来相对较为容易。

《建设工程合同管理》

是四个科目中相对较容易的一门。该科目主要考察考生对于建设工程合同管理的基本原则和方法的了解程度。内容体系单一，主要涉及建筑工程合同的签订、履行和管理等方面，需要考生熟悉建筑工程合同的一些基本概念和流程。

综上所述，监理工程师考试的科目难易程度排名为：《建设工程监理案例分析》最难，其次是《建设工程目标控制》，然后是《建设工程基本理论与相关法规》，最后是《建设工程合同管理》。建议考生在备考过程中，可以根据这一排名有针对性地进行复习，以提高考试通过率。