水利总监理工程师的证书主要是指 全国水利工程建设总监理工程师岗位证书。该证书是由中国水利工程协会颁发的，根据企业需求，按照自愿原则为已取得水利监理工程师资格证书的人员提供的免费服务。企业可以根据业务需要自愿选择是否申请该证书。

虽然之前有提及国家水利部组织的考试和资格证书，但目前的政策是取消水利工程建设总监理工程师职业资格，各监理单位可根据工作需要自行聘任满足工作要求的监理工程师担任总监理工程师，因此，目前并不需要考取国家水利部颁发的水利总监理工程师证书。

建议您根据最新的政策要求，选择是否申请全国水利工程建设总监理工程师岗位证书，并确保满足相关的企业要求和条件。