监理工程师证书三年没有注册 不会作废，但需要满足一定条件才能重新注册。以下是具体的要求和流程：

证书不会作废

监理工程师证书即使三年未注册，也不会自动失效。已经取得监理工程师岗位证书的，其执业资格证书仍然有效。

需要参加继续教育

超过三年未注册的情况下，持证人需要重新参加继续教育，以补齐未注册期间应完成的继续教育学时。

重新提交注册材料

在重新申请注册时，持证人需要提交更详细的注册材料，并可能需要接受注册审批部门的重新审查。

满足其他注册条件

除了继续教育要求外，持证人还需要满足其他注册条件，如年龄、刑事处罚记录等。

建议及时咨询

由于不同地区的具体操作流程可能有所不同，建议持证人及时联系当地的建设部门或相关机构，以获取详细的重新注册流程和要求。

综上所述，虽然监理工程师证书三年未注册不会作废，但持证人需要按照相关规定参加继续教育、重新提交注册材料，并满足其他注册条件，才能顺利恢复其执业资格。