选择交通大学的专业时，可以考虑以下几个因素：

专业特色与优势

上海交通大学：机械工程、电子信息类、船舶与海洋工程、材料科学与工程、生物医学工程、工商管理。

重庆交通大学：土木工程、交通运输工程、水利工程、汽车服务工程、工程造价、物流管理。

北京交通大学：通信工程、轨道交通信号与控制、电子科学与技术、自动化、计算机科学与技术。

个人兴趣与发展方向

选择专业时，建议结合自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业方向。例如，对交通系统感兴趣的学生可以选择交通运输工程或相关王牌专业；对计算机科学和软件开发感兴趣的学生可以选择软件工程或计算机科学与技术专业。

行业需求与发展趋势

考虑当前及未来行业的需求和发展趋势，选择具有广阔就业前景的专业。例如，轨道交通、人工智能、大数据、智能控制、机械设计与制造、电气工程及其自动化、电子电路、交通工程、轨道控制等领域都是当前及未来需求较大的领域。

学校的地理位置和特色

不同地区的交通大学可能有不同的专业优势和特色。例如，大连交通大学在轨道交通领域具有明显优势，而重庆交通大学在土木工程和交通运输工程领域享有高知名度。

专业排名和师资力量

查看专业排名和师资力量，选择实力和声誉较高的专业。例如，西安交通大学在动力工程及工程热物理、电气工程、力学、机械工程、数学、工商管理等多个学科领域都获得了A+级评分。

综合以上因素，以下是一些建议的专业选择：

上海交通大学：机械工程、电子信息类、船舶与海洋工程、材料科学与工程、计算机科学与技术、土木工程。

重庆交通大学：土木工程、交通运输工程、水利工程、汽车服务工程、工程造价、物流管理。

北京交通大学：通信工程、轨道交通信号与控制、电子科学与技术、自动化、计算机科学与技术。

最终选择哪个专业，还需结合个人的兴趣、职业规划以及学校的具体情况进行综合考虑。