物化生（物理、化学、生物）专业的学生选择日语作为第二语言时，在报考专业时会有以下选择：

日语相关专业：

如日语专业、日本文化、日本经济等。

理工科专业：

如电子信息、计算机科学、化学、物理、药学、化学工程等。

智能化专业。

经管类专业。

医学专业。

需要注意的是，加上日语专业后，有些专业如军事、国防、公共安全等不能选择，因为这些专业通常要求主课是英语。

根据以上信息，物化生选择日语作为第二语言时，专业选择范围较广，涵盖了语言、理工科、经管、医学等多个领域。建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业。