自考本科毕业后的档案合并流程如下：

准备材料

身份证原件及复印件

学历证书原件及复印件

学位证书原件及复印件（如有）

自考毕业生登记表

学信网电子注册备案表（如有）

档案袋（如果已有）

其他可能需要的证明文件（如委托书及被委托人身份证原件及复印件，如果委托他人办理）

检查档案完整性

确认自考本科档案是否完整，包括是否有密封条和档案材料是否齐全。如果档案未密封，需要到继续教育学院或自考办重新密封并盖章

提交申请

前往当地的人才服务中心或人社局提交档案合并申请，并填写申请表格

审核

提交申请后，等待审核结果。审核通过后，工作人员会指导你进行档案合并操作，通常需要填写一份档案转移单，并进行相关材料的移交

合并档案

审核通过后，将自考本科的档案合并到现有的档案中，完成档案合并。合并方式主要有以下几种：

与全日制统招大专档案合并

基于高中/中专档案，再添加自考大专档案

将高中/中专档案、自考大专档案与自考本科档案三者合一

档案存放

完成合并后，通常需要将个人档案存放在人才中心或人才市场，以便后续使用

建议

提前咨询：不同地区和部门的具体流程和要求可能会有所不同，建议在办理前先咨询当地人才中心或人社局了解具体情况。

保持材料完整：确保所有材料齐全且密封，以避免影响档案合并的进度。

选择合适的合并方式：根据个人情况和档案存放单位的要求，选择合适的合并方式，以确保档案能够顺利合并并存放。