不愿意报考研究所的原因主要有以下几点：

招生要求严格 ：研究所的研究生招生要求通常比普通学校更高，需要经过更严格的考核和筛选，竞争压力较大。

学习环境不便 ：研究所的研究生虽然在学校学习，但主要在研究所进行科研，这种安排相对不便。

生活活泼度不高 ：科学研究院通常是独立的研究机构，没有大学研究院的配套好，学生生活活泼度不高。

招生名额少 ：研究所录取人数较少，考生容易被淘汰，导致许多考生不报考研究院所。

考试难度高 ：考研难度较大，且科研院所的考试难度通常比普通大学更高，需要考生有丰富的科研经历和较高的学术水平。

工作强度和压力 ：科研院所的工作强度和压力较大，可能会让考生失去对学科的热爱，甚至感到麻木和厌倦。

学术独立性难以保证 ：在科研院所工作可能会面临各种利益和压力，难以保证学术独立性。

环境和氛围不同 ：科研院所的环境和氛围与学术界有很大不同，需要面对政治和经济等各种因素，工作更加复杂和艰难。

自由度低 ：科研院所的自由度相对较低，生活可能更偏向于工作而非学习。

专业设置存在问题 ：某些院校所开设的研究生专业可能与实际就业市场的需求脱节，导致职业发展困境。

社会知名度较低 ：尽管科研院所在业界的专业性被普遍认可，但在社会上其“知名度”可能不如“985”､“211”等院校，这可能会影响到一些用人单位的青睐。

人脉资源有限 ：与高校相比，科研院所的学生数量较少，因此结识的人也相对较少，这可能会影响未来的人脉资源。

生活单一 ：科研院所的日常生活可能没有高校那么丰富多彩，更接近于工作状态，可能缺少校园文化和活动。

就业选择较窄 ：科研院所的研究方向可能较为特定，如果研究方向与市场需求不匹配，可能会影响毕业生的就业选择。

认同感和虚荣心 ：一些科研院所不属于“985”或“211”工程，可能无法满足一些人对于学校品牌的认同感和虚荣心。

工作与生活平衡 ：科研工作往往要求高度投入，可能会牺牲个人生活时间，这对于追求工作生活平衡的人来说可能是一个考虑因素。

转制科研院所的挑战 ：一些转制科研院所在转型为创新型企业时面临挑战，如技术创新环境不具备，可能导致科研资源削弱。

职业发展体系 ：科研院所的职业发展体系可能存在理念落后、模式落后、设计落后等问题，影响员工的职业发展和工作满意度。

性别歧视 ：尽管这不是普遍现象，但个别科研院所在招聘过程中可能存在性别歧视问题。

综上所述，虽然研究所有其优势，如招生人数少、培养动手能力强等，但考虑到招生要求高、学习环境不便、生活活泼度低、竞争压力大等因素，许多考生可能不愿意选择报考研究所。