公司代扣个税的会计分录包括计提工资、发放工资、缴纳个税和社保等流程。申报个税时包括个人社保部分。企业代扣代缴社保时，个人社保部分也是申报个税的工资里的。摘要字数控制在200字以内。

公司代扣个税的会计分录处理如下：

工资计提

借：管理费用—工资

贷：应付职工薪酬—工资

工资发放

借：应付职工薪酬—工资

贷：银行存款

其他应付款—个人社保

应交税费—个人所得税

缴纳个人所得税

借：应交税费—个人所得税

贷：银行存款

社保计提

借：管理费用—社保单位

贷：应付职工薪酬—社保单位

五、缴纳社保

借：应付职工薪酬—社保单位

其他应付款—个人社保

贷：银行存款

关于申报个税是否包括个人社保部分，答案是肯定的。在个税申报过程中，需要考虑个人社保部分。例如，当计提工资为10000元，代扣的社保为1000元时，实际发放给员工的工资是9000元。这1000元的个人社保部分，虽然是从工资中扣除并作为代扣代缴的义务进行缴纳，但它依然属于工资性质，因此在进行个税申报时，应以此作为申报依据，按照应付的计提工资进行申报，包括个人社保部分。在个税申报时，应按全额工资（包括个人社保部分）进行申报。