企业交纳的水资源税应计入 应交税费—应交水资源税科目进行核算。具体分录如下：

计提水资源税时

借：税金及附加

贷：应交税费—应交水资源税

实际缴纳水资源税时

借：应交税费—应交水资源税

贷：银行存款

通过以上分录，企业可以准确核算其应纳和已纳的水资源税，确保税务处理的合规性和准确性。