现金支票存根在支票付款流程中扮演着重要角色，具体作用包括：

确认交易信息：

现金支票存根详细记录了支票的基本信息，如支票号码、日期、收款人名称、金额、用途等，这些信息有助于确认交易的真实性。

证明权利归属：

存根上记录了付款人的账号和开户银行，收款人的名称以及款项金额等信息，这些信息证明了资金的所有权和流向。

保证交易有效：

存根作为支付凭证，是收付账目的有效证明，确保交易的有效性，减少因交易不明确而产生的理赔风险。

便于查询和核对：

存根上的信息有助于在日后查询和核对支付情况，确保财务记录的准确性和完整性。

辅助财务分类和核算：

存根上注明的用途可以帮助财务人员将支出准确地分类到不同的会计科目中，从而编制出更准确的财务报表。

协助财务审计：

审计人员在审查财务记录时，会查看支票存根以验证支付的合法性、准确性和合理性，存根的完整性和清晰度直接影响审计的效率和准确性。

预防欺诈和错误：

通过定期核对支票存根与银行对账单，可以及时发现不一致之处，从而预防潜在的欺诈行为或记账错误。

综上所述，现金支票存根不仅是支付过程的重要环节，也是企业和个人财务管理中不可或缺的凭证，有助于确保财务记录的准确性、合规性和安全性。