核定进项税的主要目的包括以下几点：

确保税收公平：

通过规范农产品进项税额的核定和管理，确保所有农产品生产经营者按照统一的标准核定和申报进项税额，避免个别企业通过不当手段减少纳税额，从而维护税收的公平性。

促进农产品生产经营发展：

通过降低农产品生产经营者的税收负担，鼓励他们增加投资和创新，进而促进农产品生产经营的健康发展。

减少税收风险和纳税争议：

明确农产品进项税额的核定办法，规范纳税人的行为，从而减少税收风险和纳税争议的发生，提高税收征管的效率。

保护农产品市场秩序：

防止虚假农产品进项税额的出现，保护农产品市场的秩序，维护正常的市场竞争环境。

加强增值税抵扣管理：

实施核定扣除办法，调整和完善农产品增值税抵扣机制，加强管理。

解决税制设计问题：

改变原有的凭票定率扣除方式，消除“高征低扣”的不合理现象，鼓励企业规范财务核算，促进相关行业的健康发展。

避免虚开发票：

通过核定征收，减少企业因缺少进项发票而导致的税款负担，从而避免虚开发票等违法行为。

综上所述，核定进项税不仅有助于确保税收的公平性和合规性，还能促进农业及相关行业的发展，同时减少税收风险和纳税争议，保护市场秩序。