卷烟批发企业采取汇总纳税的方式，主要是基于以下几点考虑：

便于税务管理和核算：

卷烟批发企业可能在不同地区设有分支机构，总机构与分支机构不在同一地区时，由总机构申报纳税可以简化税务管理和核算流程。

适应专业化协作发展：

企业集团和设有分支机构的企业采取汇总纳税，可以适应企业集团跨地区、跨行业经营的需要，使得部分成员企业在经营上难以独立核算或核算不能反映企业的真实情况时，仍能集中管理和反映整个集团的财务状况。

加征消费税：

针对卷烟批发环节要加征一道消费税，因此直接规定总机构申报纳税，以便于税务当局对卷烟批发环节的消费税进行统一征收和管理。

请注意，具体的税务规定可能会随着时间和政策的变化而变化，因此在实际操作中应以当地税务局的规定为准。