水费税率为3%的原因主要在于 水费可以适用简易征收方法。简易征收是一种简化的增值税征收方式，适用于一些特定的商品和服务，其税率相对较低。根据相关税务法规，水费作为公共服务的一部分，可以选择按照简易征收方法，即按照3%的税率来计算增值税。

此外，物业管理公司在提供自来水服务时，也可以按照简易计税办法，即依照3%的征收率计算缴纳增值税。

需要注意的是，虽然自来水公司销售自来水时，自身可能按照9%的税率进行销售，但在向物业管理公司或其他服务接受方收取水费时，物业管理公司可以适用3%的简易征收税率。

综上所述，水费税率为3%主要是基于简易征收方法的应用。