农产品计算抵扣的原因主要有以下几点：

平衡税收负担

农业生产者销售自产农产品享受免税政策，为了不使增值税抵扣链条在农业环节中断，给予购进农产品企业计算抵扣进项税额的权利，促进农业产业与其他产业的衔接与协同发展。

鼓励农产品消费

财政部门为鼓励农产品消费者，特设定抵扣政策，即可以将农产品消费者的税收减按比例减免，免去部分负担，以此促进消费者的支出。

减轻税负

农产品计算抵扣政策有助于减轻购买人的税负，购买者在购入农产品时可以抵扣进项税额，销售时再抵扣，从而降低整体税收负担。

促进产业发展

通过抵扣政策，可以促进农业产业与其他产业的衔接与协同发展，推动整个产业链的良性循环。

具体抵扣方式

购进农产品时，企业可以凭取得的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书进行抵扣。此外，还可以凭农产品收购发票或销售发票上注明的金额乘以一定扣除率（如13%或9%）计算进项税额进行抵扣。

特殊政策

对于购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，可以按照10%的扣除率计算进项税额，即可以加计扣除1%的进项税额。

综上所述，农产品计算抵扣政策旨在通过税收激励，促进农业产业的发展，同时减轻农产品购买者和生产者的税收负担，推动整个产业链的良性循环。