发票勾选认证的主要目的是为了 抵扣进项税额。一般纳税人企业在计算增值税时，通过销项税额减去进项税额和其他可以抵扣的税额来计算应缴纳的增值税额。发票勾选认证是企业确认进项税额的必要步骤，只有经过勾选或其他方式认证后的发票，才能作为进项税额进行抵扣。

具体来说，发票勾选是指企业在购买商品或接受服务后，在税务系统中将该笔交易的发票信息进行勾选，表示已确认该笔交易的真实性和合法性。而发票认证则是企业在勾选发票后，在规定时间内将发票信息提交给税务机关进行进一步确认，以确保该笔交易的合法性。这一过程是企业纳税过程中不可或缺的一部分，也是税务机关对企业纳税情况进行监管和管理的重要手段。

此外，发票勾选认证还有助于避免滞留票风险。滞留票是指销售方已抄税报税，但购货方未进行认证抵扣的增值税专用发票。大量滞留票可能会引起税务机关的关注，并可能导致企业面临稽查和处罚。因此，企业需要及时完成发票认证，确保合规性，避免不必要的法律风险。

综上所述，发票勾选认证是确保企业合规抵扣进项税额、降低税负水平、避免法律风险的重要措施，同时也是税务机关加强税收管理、保障税收公平性的重要手段。