房地产不能抵扣的原因主要涉及以下几个方面：

增值税抵扣链条不完整

建筑物在再销售时，开据的是营业税销售不动产发票，不属于增值税范畴，因此购进货物或接受劳务支付的增值税进项税额不得抵扣，需要计入建筑物的成本。

营改增政策限制

虽然营改增政策规定企业新购置的生产经营用房的进项税额可以进行抵扣，但出售房地产并不能抵税。

房产税和个人所得税的税种属性

房产税属于产权税范畴，个人所得税属于所得税范畴，两者不可抵扣。

非正常损失的情况

非正常损失的不动产及其相关服务的进项税额也不得抵扣。

综上所述，房地产不能抵扣的原因主要包括增值税抵扣链条的完整性、营改增政策的具体规定、房产税和个人所得税的税种属性，以及非正常损失情况下的进项税额处理。