资源税采用代扣代缴的方式主要是出于以下几个原因：

便于征收管理：

资源税涉及的对象可能非常分散，如小规模的矿产品开采等，直接征收难度较大。通过代扣代缴，税务机关可以更有效地管理税源，减少直接监管的压力。

节约征收成本：

代扣代缴将征税环节前移至收购环节，避免了税务机关在多个分散的纳税点进行征收，从而节省了征收成本和时间。

明确纳税义务：

在收购未税矿产品的过程中，收购单位作为扣缴义务人，负责从支付给矿产品卖方的款项中直接扣除应代扣代缴的资源税，这样既明确了收购单位的责任，也确保了税款能够及时入库。

防止税收流失：

对于税源小、零散且不定期开采的矿产品，税务机关难以直接控管。通过代扣代缴，可以有效防止税款流失，确保税收的公平性和合法性。

综上所述，资源税采用代扣代缴的方式，主要是为了简化税收征收流程、降低成本、明确纳税义务，并有效防止税收流失。