云南机场亏损的原因可以归纳为以下几点：

高铁竞争

近年来，云南省内高铁的陆续开通，对民航客运量形成了分流，导致云南机场的客运量下降。

旅游市场影响

受负面信息影响，云南旅游市场不如从前，而云南民航最大的需求来源是省外游客。

财务费用和折旧

新机场建设时，公司需要融资，这带来了较高的财务费用。

新机场转为固定资产后，需要计提折旧，短期内会对机场的经营造成压力，甚至可能导致亏损。

航空公司竞争

云南曾有国内主基地航空公司最多的省份，竞争激烈，导致航空公司在云南市场赚钱困难。

油价和运营成本

油价持续走高，给国内航空公司运营带来压力。

航线燃油附加费提高后，支线票价吸引力减弱。

航线运营问题

某些航线如昆明——西双版纳——昆明航线经营权被暂停，影响了西双版纳航线和航班。

泰国曼谷航空有限公司停航西双版纳机场，深圳航空有限责任公司在西双版纳未能充分发挥基地作用，投入运力有限和航线网络单一。

这些因素综合作用，导致了云南机场的经营亏损。