优秀员工的奖金个人所得税计算遵循以下步骤：

1. 将奖金全额计入当月工资薪金所得。

2. 从总和中减去起征点（目前为5000元）和专项附加扣除等。

3. 根据剩余金额按照适用的超额累进税率计算税额。

例如，如果某员工获得奖金10000元，月工资为5000元，无其他扣除，则计算如下：

应纳税所得额 = 奖金 + 月工资 - 起征点 = 10000 + 5000 - 5000 = 10000元

根据超额累进税率表，10000元属于第2级，适用税率为10%，速算扣除数为210元。

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数 = 10000 × 10% - 210 = 1000 - 210 = 790元

因此，该员工应缴纳的奖金个人所得税为790元