农产品计算抵扣的计算方法如下：

基本计算公式

进项税额 = 买价 × 扣除率

不同情况下的扣除率

一般纳税人购进农产品，通常情况下扣除率为9%。

如果用于生产或委托加工13%税率的货物，扣除率为10%。

从按简易计税方法、依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人处取得增值税专用发票，扣除率为9%。

特殊规定

纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，在领用当期可以再加计扣除1%的进项税额，即扣除率为10%。

至2027年12月31日前，一般纳税人从小规模纳税人处取得的按1%征收率开具的增值税专用发票，只能抵扣1%，不能抵扣9%，也不能加计扣除。

请根据您的具体情况选择合适的计算方法和扣除率进行抵扣计算