加盟总店的会计分录主要包括以下几个方面：

支付加盟费

借：无形资产-特许经营使用权 应交税费-应交增值税 （进项税额）

贷：银行存款

按照合同约定的预计使用年限摊销

借：管理费用-无形资产摊销

贷：累计摊销

支付加盟保证金

借：其他应收款-加盟保证金

贷：银行存款

初始投资 （如店铺装修、购买设备、首批商品采购等）：

借：长期待摊费用-店铺装修、固定资产设备、库存商品

贷：银行存款

商品采购

借：

库存商品 应交税费-应交增值税（进项税额）

贷：银行存款

销售商品

借：银行存款

贷：主营业务收入 应交税费-应交增值税（销项税额）

借：主营业务成本

贷：库存商品

收到加盟费的品牌方

借：银行存款

贷：主营业务收入/其他业务收入

这些会计分录涵盖了加盟总店在支付加盟费、摊销费用、处理初始投资、商品采购和销售等日常经营活动中的主要财务操作。建议在实际应用中，根据具体的合同条款和业务需求进行适当的调整，并确保所有分录符合当地的会计准则和税务法规。