支票存根的会计分录主要涉及以下几种情况：

付出去的支票存根

借：应付账款（或预付账款或费用类相关科目）

贷：银行存款

收到现金支票存根

借：现金

贷：银行存款

存入银行的转账支票（收入）

借：银行存款

贷：应收账款（或预收账款等）

支付货款时使用的现金支票存根

借：应付账款/其他应付款

贷：银行存款

这些分录反映了企业在使用支票进行支付或收款时的会计处理过程。具体分录的选择应根据支票的类型（现金支票或转账支票）和企业的财务状况（如应付账款、预付账款等）来确定。

建议在实际应用中，根据具体的业务场景和会计准则，选择合适的会计分录进行记录，以确保账务处理的准确性和合规性。