行政会计年末余额的计算方法如下：

计算本年年末余额

本年年末余额 = 本年年初余额 + 本年增加数 - 本年减少数。

结转收入和支出

将收入类科目余额转入“结余”科目的贷方。

将支出类科目余额转入“结余”科目的借方。

处理专项资金收支

对于专项资金收支，将非专项收支转入“结余”的“经常性结余”明细科目，专项收支转入“结余”的“专项结余”明细科目。

编制结账后资产负债表

根据转入的收入和支出科目余额，计算出当年的盈余或亏损。

其他结转事项

将“财政补助收入”贷方余额转入“事业结余”科目。

将经营支出借方余额转入“经营结余”科目。

对已完工项目，对冲“拨入专款”与“拨出专款”及“专款支出”科目。

将“事业收入”贷方余额全部转入“事业结余”科目。

通过以上步骤，可以确保行政会计年末余额的准确计算，并反映单位财务状况和资金流动情况。建议在计算过程中细心核实每一笔收入和支出，避免统计错误和遗漏。