工程合同款的会计分录主要包括以下几个阶段：

合同签订阶段

当企业作为承包方签订合同时，需记录应收账款的增加和合同负债的增加。

分录示例：

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借:应收账款（或应收票据） 1000万元

贷:合同负债 1000万元

```

收到预付款

收到甲方支付的预付款时，记录银行存款的增加和预收账款的增加。

分录示例：

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借:银行存款

贷:预收账款——工程计量

```

收到进度款

根据合同约定或实际完成的工作量，收到进度款时，记录银行存款的增加和在建工程的增加。

分录示例：

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借:银行存款

贷:在建工程

```

确认收入和成本

在工程施工过程中，随着材料、人工和其他成本的投入，需要确认相应的收入和成本。

分录示例：

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借:在建工程

贷:原材料、应付职工薪酬、机械作业等

```

确认收入时：

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借:预收账款

贷:应交税费——应交增值税

贷:主营业务收入

```

工程完工结算

工程完工并通过验收后，进行最终的结算，记录银行存款的增加和工程结算的增加。

分录示例：

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借:银行存款

贷:工程结算

```

同时，将工程施工科目的余额与工程结算科目的余额对冲：

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借:工程结算

贷:工程施工——合同成本

```

合同尾款处理

在建设项目完全竣工并且经验收合格办理竣工决算后，收回工程尾款。

分录示例：

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借:银行存款

贷:应收账款——工程结算尾款

```

拆除工程合同款处理

拆除工程合同款的相关会计分录包括合同签订、款项支付、工程进度款结算、合同变更、工程验收等。

分录示例（签订合同发生的费用）：

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借:合同签订费用

贷:银行存款/现金

```

分录示例（预付款）：

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借:预付账款

贷:银行存款/现金

```

这些分录涵盖了工程合同款从签订到完工结算的各个阶段，确保了会计处理的准确性和完整性。需要注意的是，具体的会计分录可能会因公司的会计政策和财务制度而有所不同，建议在实际操作中参考相关的会计准则和法规，并结合公司的实际情况进行处理。