根据查询相关资料显示：不可以的，如果企业存在欠税的情况，会被列入异常户，非正常户是无法办理水利基金退还的。水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金.水利建设基金应按照销售收入的0.1%来计提和交纳，向主管税务机关申请办理时需要提交以下材料：

1、填写“退抵税(费)申请审批表”一式2份。

2、税款入库凭证复印件。

3、税务登记证副本复印件。

4、多缴税费其他证明资料原件及复印件。

5、不能退至纳税人原缴款账号的，需要提供新账号及说明材料。