工程工本费应计入工程成本科目。

详细解释如下：

1. 工程成本科目概述：

工程工本费是指在进行工程建设过程中，与工程实体直接相关的成本支出。这些费用包括材料费、设备费、人工费以及与此相关的其他直接费用。为了更好地管理和核算工程成本，企业会设置专门的工程成本科目。

2. 工本费的具体内容：

工程工本费包括施工图纸费用、材料费用、部分设备费用以及施工过程中的其他与工程实体直接相关的费用。这些费用都是构成工程总成本的重要部分，需要准确核算和记录。

3. 会计处理方式：

在实际会计处理中，工程工本费应当计入工程成本科目。随着工程的进展，根据费用发生的实际情况进行记账，反映在工程成本科目中。这样，企业可以清晰地了解每一项工程的成本构成，有助于进行成本控制和盈利分析。

综上所述，工程工本费应被归类为工程成本的一部分，并在会计记账时相应计入工程成本科目，以便准确反映企业的工程成本情况和经济效益。