货物运输增值税税率根据企业性质不同税率不同，对于一般纳税人企业而言，货物运输增值税税率为9%，而对于小规模企业而言，货物运输增值税税率为3%，现阶段执行1%的税率，另外需要说明的是，物流或者运输辅助服务一般纳税人的税率为6%。