普通增值税发票查询结果不一致是什么原因：

1、发票本身有问题。可能是套票。

2、发票是从税务局领的正规发票，但是没有按照正确的步骤操作结果发票开具的金额电脑上并未有采集。就导致发票开出的金额与税务机关采集的金额不一致了。

3、可能对方开具发票后又作废了。