保函保证金是指公司为了从银行取得投标保函或履约保函等而向银行交存的一定数额款项。

支付保证金的时候：

借：其他应收款-保证金，

贷：银行存款，

后期收回保证金的时候：

借：银行存款，

贷：其他应收款-保证金。