日本留学回国后需要办理的手续和材料可分为以下几类，综合多个权威信息源整理如下：

一、回国证件与材料

留学回国人员证明

需提供护照首页和签证页原件及复印件、毕业证书原件及复印件、学校证明信（含入学/毕业时间）、单程回国机票、留学生登记表及1寸照片。

学历学位认证

基本材料 ：国外学位证/毕业证原件及复印件、中英文成绩单（建议日文+英文）、护照及出入境记录复印件。

特殊情况补充 ：

毕业证丢失需提供学校出具的《毕业证明书》或学籍管理部门有效证明；

身份信息变更需补充身份证号更正证明或招生录取名册。

二、国内手续

户籍与社保迁移

办理迁出户籍（如原籍为农村需迁出届）及退国民健康保险；

新宿区居民可通过官网在线办理迁出手续。

税务相关

办理银行账户注销及退税手续（需1-2周处理国际汇款）。

三、居住与就业相关

在留卡办理

入境后需在14天内办理在留卡及居住登记，用于后续在留资格变更、社保缴纳等；

在留期间可随时回国，但1年以上长期回国需重新申请在留卡。

居留许可变更

移动住址需在2周内到新住址所在行政窗口办理变更登记。

四、其他注意事项

银行账户 ：建议提前办理邮政储蓄银行账户（半年内禁止接收海外汇款）；

手机卡解约 ：需解除与银行卡绑定的手机卡，避免欠费影响信用记录；

购房购车 ：回国1年内可申请免税车资格，但需符合车型限制。

以上流程和材料需根据个人具体情况调整，建议提前联系中国驻日使领馆或教育部留学服务中心确认最新要求。