南京高考被认为难度较大的原因主要有以下几点：

计分制：

南京高考总分是480分，此外还要看小高考成绩和计算机测试成绩。计算机测试没达标不允许参加高考，数学试卷没有选择题，学生无法蒙分。

教育资源分布不均：

南京的学生基数大，但办学资源分布不均，导致一些地区的高中和学生获得的资源较少，这影响了南京高考的整体成绩。

顶尖学生选择其他途径：

南京的一些顶尖学生凭借成绩或家庭实力，不参加高考，而是直接保送名校或出国留学，这使得南京高考的成绩受到一定影响。

试卷难度：

江苏的考题一直被认为很难，很多考生无法完成试卷。江苏考生在上大学后，会发现其他省份的同学在做题上存在差距，如矩阵、积分、柯西不等式等题目在江苏考生高中就已经学过。

升学竞争激烈：

江苏省内的好学校较多，但一本率、211率和985率并不高。尽管有众多优质高校在江苏，但录取竞争依然激烈。

中学资源有限：

苏南地区的教育资源相对较好，而苏北地区每个县只有一所四星级高中，学生上不了这些学校就只能靠自己学习，这也增加了高考的难度。

综合以上几点，可以看出南京高考难度较大的原因主要包括计分制、教育资源分布不均、顶尖学生选择其他途径、试卷难度、升学竞争激烈以及中学资源有限等方面。尽管如此，南京的高考难度相对于其他省份可能仍然有一定的竞争力，因为江苏和南京的教育资源仍然较为丰富，且高校数量较多。