自考环境工程本科专业的主要考试科目包括：

1. 中国近现代史纲要

2. 马克思主义基本原理概论

3. 环境化学

4. 环境微生物学

5. 环境工程导论

6. 环境规划与管理

7. 水污染控制工程

8. 环境法学

9. 环境分析与监测

10. 英语（二）

11. 工程制图

12. 工程经济

13. 大气污染控制工程

14. 创业学

15. 环境问题案例分析（实践）

16. 物理污染控制技术

17. 环境影响评价

18. 大气污染控制工程（实践）

19. 环境影响评价（实践）

20. 环境工程毕业论文

21. 水污染控制工程（实践）

22. 环境分析与监测（实践）

请注意，各院校自考专业考试科目可能有所不同，请以各省公布的考试科目为准