办理焦作运输资格证需要遵循以下步骤：

申请

向辖区运政管理机关提出申请，并填写从业资格证申请登记表一式三份。

携带身份证、驾驶证、结业证及《从业资格证》（限增驾）原件及复印件二份，同版1寸彩色照片5张。

职业培训

根据要求，申请人需要参加由有培训资质的驾校进行的培训。

从业资格考试

培训合格后，申请人需要参加从业资格考试，包括笔试和实地驾驶（如倒杆、移库）。

领取证件

考试合格后，申请人需到交通运输管理所（领表地）领取从业资格证。

换证处理

如果运输资格证超过了有效期，但未超过有效期180天，可以直接到发证机关正常申请换证。

如果超过了有效期180天，但未超过有效期两年，可以到发证机关申请参加理论考试，考试合格后办理换证手续。

如果超过了有效期两年以上，证件作废，需要重新办理。

建议在办理过程中，提前咨询当地运政管理机关或驾校，了解具体的申请流程和所需材料，以确保办理过程顺利。