初中教资笔试可以只考两门科目。具体来说，初中教师资格证的笔试科目包括《综合素质》、《教育教学知识与能力》和《学科知识与教学能力》三科，但报名时只报两科是可以的。

需要注意的是，所有科目都需要通过后才能参加面试考试，而笔试单科成绩是可以保留两年的。因此，如果这次通过了两科，剩下的一科目可以下次再报考，只需报这一门就可以了。

建议考生根据自己的实际情况和准备情况，选择报考两门科目，以便更好地安排备考时间和精力。