明治大学修士课程的学费如下：

一般学科 （法学、商学、政治经济学、经营学、文学（临床人类学除外）、信息交流、教养设计及国际日本学研究科）：一年823,000日元，折合人民币约39,871元。

文学研究科临床人类学：

一年873,000日元，折合人民币约42,294元。

理工学（农学（农艺化学、农学、生命科学）、先端数理科学研究科）：一年1,123,000日元，折合人民币约54,405元。

农学研究科农业经济学专业：

一年1,011,000日元，折合人民币约48,979元。

综上所述，明治大学修士课程的学费在3.9-5.5万元人民币之间，具体金额取决于所学专业。