金陵大学在抗战时期的学生人数如下：

1938年3月1日：

学生387人。

1938年春：

学生增至557人。

1939年秋间开学：

学生584人。

1940年秋注册：

学生787人。

因此，金陵大学在抗战时期的学生人数最高峰值出现在1940年秋，共有787名学生注册。