选择武汉或南京的专业时，可以考虑以下几个方面：

学科优势

南京：在理工类和社会人文专业方面较强，南京大学和东南大学的理工类专业尤其突出，南京师范大学在文科方面也有一定的优势。

武汉：在法学、水利、测绘、医学等领域表现突出，武汉大学和华中科技大学的理工类专业在国内处于上层水平。

城市因素

南京：作为江苏省会，经济发达，就业机会多，国际化程度较高。

武汉：作为中部地区的重要交通枢纽，发展势头猛，生活成本相对较低。

学校实力

南京：南京大学和东南大学都是顶尖的985高校，综合实力较强，专业均衡。

武汉：武汉大学和华中科技大学也是顶尖的985高校，但在某些特定领域如材料与光电有优势。

个人兴趣和目标

如果对理工类和社会人文专业感兴趣，且希望在城市国际化程度较高的城市发展，南京可能更适合。

如果对法学、水利、测绘、医学等领域感兴趣，且希望在中部地区发展，武汉可能更适合。

生活成本

武汉的生活成本相对较低，可能更适合预算有限的学生。

综合考虑以上因素，如果更看重学科实力和特定领域的强势专业，且希望在国际化程度较高的城市发展，南京可能更适合；如果更看重特定领域如法学、水利、测绘、医学等，且希望在中部地区发展，武汉可能更适合。最终的选择还应结合个人的专业兴趣、兴趣爱好以及未来发展规划等因素综合考虑。