以下是生物工程专业考研院校排名：

北京大学

清华大学

上海交通大学

浙江大学

复旦大学

中国农业大学

武汉大学

南京大学

西北农林科技大学

华侨大学

西安交通大学

河北大学

华东理工大学

天津大学

广西大学

湖南农业大学

福建师范大学

南京农业大学

合肥工业大学

华南农业大学

四川农业大学

东南大学

建议：

北京大学、 清华大学、 上海交通大学、 浙江大学和 复旦大学等综合性大学在生物工程专业方面具有很高的声誉和科研实力，是考研的理想选择。

西北农林科技大学、 南京林业大学等农业类大学在生物工程专业方面也有很好的表现，适合对农业领域感兴趣的学生。

华东理工大学、 天津大学等工科类大学在生物工程专业方面也有较强的实力，适合希望从事生物工程相关技术开发和应用的学生。

请根据个人兴趣、学术目标和实际情况选择合适的院校。