南通大学的二本专业排名如下：

临床医学

土木工程

电气工程及其自动化

汉语言文学

机械工程及自动化

医学影像学

学前教育

预防医学

自动化

口腔医学

这些排名是根据南通大学二本专业的录取平均分历史数据从高到低排序得出的，排名越高，专业分数要求越高。