南京院校的专业排名如下：

南京大学

综合类大学排名：全国第6名，有90个专业上榜，其中39个为A+专业。

顶尖学科：天文学（全国第一）。

王牌专业：包括哲学、天文学、地质学、图书情报与档案管理、社会学、中国语言文学等。

东南大学

综合类大学排名：全国第21名，有88个专业上榜，其中22个为A+专业。

优势学科：工科为主，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学、艺术学、历史学等。

王牌专业：建筑学、土木工程与交通运输工程、仪器科学、控制科学与工程、电力电子工程、生物医学工程等。

南京理工大学

理工类大学排名：全国第18位，有多个专业在排行榜中位于前列。

优势学科：武器系统与工程、化学工程与工艺、自动化、机械工程、电子信息工程、材料科学与工程等。

南京农业大学

综合类大学排名：全国第44位，以农业和生命科学为优势和特色。

优势学科：动物学、动物医学、植物保护等。

南京航空航天大学

综合类大学排名：全国第50位左右，以航空航天领域为特色。

优势学科：力学和机械工程专业。

河海大学

综合类大学排名：世界高水平大学，专业评星为6。

南京艺术学院

综合类大学排名：在艺术类专业方面有一定的影响力。

这些排名信息来源于不同时间点的数据，具体排名可能会有变动。建议考生在选择专业时，结合最新的排名信息和个人兴趣进行综合考虑。