根据2024年安徽物理类高考的数据，军校的分数排名如下：

国防科技大学：

大部分专业组的录取分数线在640分以上，其中053专业组的分数线高达666分。

战略支援部队信息工程大学：

具体分数线未详细列出，但根据其排名，应位于国防科技大学之后。

海军军医大学：

具体分数线未详细列出，但根据其排名，应位于战略支援部队信息工程大学之后。

陆军工程大学：

具体分数线未详细列出，但根据其排名，应位于海军军医大学之后。

空军军医大学：

具体分数线未详细列出，但根据其排名，应位于陆军工程大学之后。

因此，国防科技大学在2024年安徽物理类高考中的分数排名最高，其次是战略支援部队信息工程大学、海军军医大学、陆军工程大学和空军军医大学。