中国海洋大学设有多个学院和系部，以下是部分学院的系部设置：

海洋与大气学院

海洋科学

海洋科学类（中外合作办学）

军事海洋学

大气科学

应用气象学

化学化工学院

海洋地球科学学院

海洋生命学院

海洋生物学

海洋生物工程系

环境生态系

水产学院

水产养殖学

海洋资源与环境

海洋渔业科学与技术

食品科学与工程学院

医药学院

工程学院

海洋工程

土木工程

机电工程

自动化系

管理学院

经济学院

外国语学院

文学与新闻传播学院

法政学院

数学科学学院

基础教育中心

体育系

教育系

社会科学部

信息科学与工程学院

海事学院

海事运输科学部

轮机系统工程学部

航海学部

轮机工程学部

海洋警察学系

海洋成套设备运营学系

海事IT工程学部

海事国际学部

造船海洋系统工程学部

能源资源工程学系

海洋空间建筑学部

海洋环境学系

海洋生命科学部

海洋体育学系

机械工程学部

海洋新材料融合工程学系

电子电气信息工程学部

控制自动化工程学部

物流系统工程学系

无线电通信工程系

数字信息学系

环境工程学系

建设工程学系

海运经营管理学部

海事法学部

国际贸易经济学部

国际通商学系

海洋行政学系

英语英文系

东亚学系

上海海洋大学

水产与生命学院

海洋科学学院

食品学院

海洋生态与环境学院

经济管理学院

工程学院

信息学院

海洋文化与法律学院

外国语学院

爱恩学院

请注意，以上信息可能会有所变动，建议以学校最新公布的信息为准。