分子科学与工程专业主要学习的科目包括：

化学基础课程

无机化学

有机化学

分析化学

物理化学

结构化学

仪器分析与技术

生物化学

专业核心课程

高分子化学

化学反应工程

胶体与表面化学

化工机械基础

分子科学与工程信息学

分子设计与产品工程

跨学科课程

能源化学

催化化学

绿色化学

实验课程

化学基础实验

化学综合实验

化工类课程

化工原理

化工热力学

化学反应工程

绿色化工技术

化工设计

生物化工

化工分离工程

环境化工

化工安全与环境保护

功能材料物理性质

功能高分子材料

药物分析

材料物理性质

材料结构分析

其他相关课程

计算机在分子科学中的应用

纳米科学与技术

虚拟仿真分子合成课程设计

现代分析技术

这些课程共同构成了分子科学与工程专业的全面课程体系，旨在培养学生在分子科学与工程领域进行科学研究、技术开发、工程设计和管理的能力。