根据最新的信息，内蒙古测绘工程专业的排名如下：

内蒙古农业大学，专业排名等级为B。

内蒙古科技大学，专业排名等级未明确标注，但通常被认为是不错的学校。

建议：

内蒙古农业大学在测绘工程专业的排名中较为靠前，建议优先考虑。

内蒙古科技大学也是一个值得考虑的选项，尽管具体排名等级未明确，但其综合实力和教学水平在内蒙古地区较为认可。

建议在做出最终决定前，进一步查阅各校的详细专业介绍和课程设置，以便更全面地了解各校测绘工程专业的优势和特点。