南京航空航天大学的自动化专业在全国的排名情况如下：

2024年软科中国大学排名中，南京航空航天大学自动化专业位列全国第14名。

2024年校友会中国大学专业排名中，南京航空航天大学自动化专业全国排名11位。

建议您在选择院校和专业时，可以综合考虑这些排名信息，以及该专业的课程设置、师资力量、实验室条件等因素，以做出更为明智的选择。